Polymorphism analysis of the CTLA-4 gene in paracoccidioidomycosis patients

The CTLA-4 protein is expressed in activated T cells and plays an essential role in the immune response through its regulatory effect on T cell activation. Polymorphisms of the CTLA-4 gene have been correlated with autoimmune, neoplastic and infectious illnesses. This work aimed to verify possible associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in CTLA-4, -318C/T in the promoter and +49A/G in exon 1 and paracoccidioidomycosis (PCM) caused by Paracoccidioides brasiliensis. For this purpose, 66 chronic form PCM patients and 76 healthy controls had their allele, genotype and haplotype frequencies determined. The genetic admixture structure of the patients and controls was evaluated to eliminate ancestral bias. The comparison of frequencies indicated no significant differences between patients and controls that could link the SNPs to PCM. Groups were admixture matched with no difference observed in population ancestry inference, indicating that the absence of association between CTLA-4 polymorphisms and PCM could not be attributed to ancestral bias. This study showed that there was no association between the CTLA-4 SNPs -318 and +49 and the resistance or susceptibility to PCM.

Population analysis of vitamin D receptor polymorphisms and the role of genetic ancestry in an admixed population

The vitamin D receptor (VDR) is an essential protein related to bone metabolism. Some VDR alleles are differentially distributed among ethnic populations and display variable patterns of linkage disequilibrium (LD). In this study, 200 unrelated Brazilians were genotyped using 21 VDR single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 28 ancestry informative markers. The patterns of LD and haplotype distribution were compared among Brazilian and the HapMap populations of African (YRI), European (CEU) and Asian (JPT+CHB) origins. Conditional regression and haplotype-specific analysis were performed using estimates of individual genetic ancestry in Brazilians as a quantitative trait. Similar patterns of LD were observed in the 5' and 3' gene regions. However, the frequency distribution of haplotype blocks varied among populations. Conditional regression analysis identified haplotypes associated with European and Amerindian ancestry, but not with the proportion of African ancestry. Individual ancestry estimates were associated with VDR haplotypes. These findings reinforce the need to correct for population stratification when performing genetic association studies in admixed populations.

Estudo comparativo da função do assoalho pélvico em mulheres continentes e incontinentes na pós menopausa / Comparative study of pelvic floor function in continent and incontinent postmenopausal women

CONTEXTUALIZAÇÃO: A incontinência urinária (IU) é de causa multifatorial, sendo atribuída, em parte, à fraqueza da musculatura do assoalho pélvico. Apesar de ser subestimada por muitas mulheres, a avaliação funcional do assoalho pélvico (AFA) pode contribuir para um correto diagnóstico e terapêutica adequada. OBJETIVOS: Comparar a função muscular do assoalho pélvico em mulheres continentes e incontinentes na pós menopausa como fator diagnóstico no tratamento da IU. MÉTODOS: A partir da investigação dos sintomas urinários, 153 mulheres (idade X=66,7±5,4) foram separadas em dois grupos (G1 incontinentes e G2 assintomáticas). Após análise dos critérios de inclusão, as mulheres foram submetidas à AFA por meio da palpação bidigital (classificação de Contreras Ortis, 1994) e à quantificação da pressão de contração perineal por meio do perineômetro (PERINA 996-2® QUARK). RESULTADOS: Observou-se prevalência de IU (54,9 por cento) na amostra estudada, sendo a incontinência urinária de esforço (IUE) (41,7 por cento) o tipo mais presente. Em relação aos sintomas urinários, como a frequência miccional diurna (p=0,004) e noturna (p=0,02), o grupo G1 apresentou um valor significativamente mais alto. A AFA mostrou resultados similares durante a palpação e o perineômetro, com diferenças significativas (p<0,001) entre os dois grupos. Utilizou-se estatística descritiva, teste t de Student para amostras independentes, medidas de prevalência e análise de variância (one-way ANOVA), seguida do post hoc de Bonferroni (p<0,05). O software Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) versão 10,0 (SPSS, Chicago, IL) foi utilizado para realização de todas as análises. CONCLUSÕES: A palpação e o perineômetro se mostraram eficientes na avaliação da força e pressão de contração desse grupo muscular.

BACKGROUND: Urinary incontinence (UI) is multifactorial and attributed, in part, to weakness of the pelvic floor muscles. Despite being underestimated by many women, a functional pelvic floor assessment (FPA) may contribute to a correct diagnosis and appropriate treatment. OBJECTIVES: To compare the function of pelvic floor muscles in continent and incontinent postmenopausal women as a diagnostic factor in UI treatment. METHODS: Based on the investigation of urinary symptoms, 153 women (age X=66.7±5.4) were divided into two groups (G1-incontinent and G2-continent). After analysis of the inclusion criteria, the women were submitted to FPA by means of bidigital palpation according to Contreras Ortiz (1994) and quantification of perineal strength with a perineometer (PERINA 996-2 QUARK®). RESULTS: There was prevalence of UI (54.9 percent) in the sample, with stress urinary incontinence (41.7 percent) as the most common. Regarding urinary symptoms such as diurnal (p=0.004) and nocturnal (p=0.02) voiding frequency, G1 had a significantly higher value. The FPA found similar results via palpation and the perineometer, with significant differences (p<0.001) between the two groups. We used descriptive statistics, the Student t test for independent samples, measures of prevalence and one-way ANOVA, followed by Bonferroni's post-hoc test (p<0.05). The software Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) version 10.0 (SPSS, Chicago, IL) was used to perform all tests. CONCLUSIONS: Palpation and the perineometer were efficient forms of assessing the force and pressure of the muscle contractions of this muscle group.

Frequency of the CCR5delta32 allele in Brazilians: a study in colorectal cancer and in HTLV-I infection

A observaçäo de que indivíduos homozigotos para uma deleçäo de 32 pares de base no gene que codifica para o receptor 5 de cc-quimiocinas apresentam um menor risco de contrair a infecçäo por HIV-1 levou à investigaçäo da freqüência deste polimorfismo em várias populaçöes mundiais. É importante investigar se o CCR5delta32 é um fator a ser considerado na epidemiologia do HIV em populaçöes individuais. Com estes pressupostos em mente nós estabelecemos a freqüência do CCR5delta32 em uma grande amostra (907 indivíduos näo-relacionados) da populaçäo urbana do sudeste brasileiro, estratificada da seguinte maneira: 322 indivíduos sadios, 354 pacientes com câncer colorretal e 229 doadores de sangue. Os três grupos apresentaram essencialmente a mesma freqüência alélica de CCR5delta32 e a comparaçäo par-a-par näo revelou diferenças significativas. Assim, os nossos resultados podem ser agrupados para fornecer uma estimativa confiável de 0,053 ñ 0,005 da freqüência alélica de CCR5delta32. Os doadores de sangue compreendiam 50 indivíduos soronegativos para HTLV-I, 115 indivíduos assintomáticos por ELISA mas com resultados indeterminados em Western blot, 49 indivíduos soropositivos para HTLV-I mas assintomáticos e 15 indivíduos soropositivos para HTLV-I sintomáticos com mielopatia. Foi observado um sugestivo gradiente decrescente da freqüência alélica de CCR5delta32 nestas categorias. Entretanto, quando aplicamos o teste exato de Fisher, näo emergiram diferenças significativas. Para uma melhor avaliaçäo da influência do alelo CCR5delta32 na probabilidade de infectar-se com HTLV-I ou de desenvolver doença clínica seräo necessários estudos com um maior número de doadores de sangue.

Screening fetal losses for monosomy X with a simple PCR-based procedure

Para a detecçäo molecular de monossomia X em perdas fetais espontâneas, nós exploramos uma estratégia baseada em perda e heterozigosidade, desenvolvendo um sistema multiplex fluorescente que permite a amplificaçäo simultânea de cinco microssatélites em uma regiäo com baixa recombinaçäo no cromossomo X. A análise foi entäo feita por densitometria a laser assistida por computador. Nenhum caso de homozigosidade em todos os cinco locos foi encontrado em 30 mulheres normais estudadas, nem em 37 mulheres cuja tipagem foi extraída do banco de dados do CEPH. Além disso, todos os casos de monossomia X previamente diagnosticadas por citogenética convencional apresentaram a prevista perda de heterozigosidade. Quando estudamos 19 casos de perdas fetais femininas do primeiro trimestre da gravidez, encontramos quatro amostras uniformemente homozigotas em todos os locos (21 por cento), de acordo com a proporçäo esperada de casos de monossomia X em perdas fetais do primeiro trimestre. Concluímos que o sistema multiplex que nós desenvolvemos apresenta alta diversidade e alta eficiência de amplificaçäo pela PCR e constitui um método simples e útil de triagem para monossomia X em abortamentos e natimortos.